為了促進閩臺農業全面合作，推進海峽兩岸合作與交流，福建省相繼編制、出臺了《海峽兩岸（福建）農業合作試驗區發展規劃》、《關于鼓勵和支持海峽兩岸（福建）農業合作試驗區建設的暫行規定》等，2009年省人大通過了大陸首個對臺農業合作地方性法規《福建省促進閩臺農業合作條例》，詳細規劃閩臺農業合作培育重點，配套相關優惠政策，鼓勵寬領域的交流與合作、實行優惠稅收政策、提供有利的土地與海域政策、加大財政金融支持力度、創造便捷的通關環境以及保護臺商的合法權益等。

由于臺灣土地資源、經營成本和市場限制等原因，臺灣農業發展受到嚴重制約。閩臺農業合作為臺灣同胞到福建再創業提供了廣闊的新天地。如臺灣天仁集團總裁李瑞河，1992年回祖籍地漳浦投資創建天福集團，從事茶葉經營，如今已建成在全國擁有1000多個直營銷售店的現代大型企業集團，取得豐厚的回報。福建農民經過引進推廣臺灣良種、技術，促進增收。比如漳州香蕉、永春蘆柑大面積示范推廣臺灣先進的栽培管理技術后，水果一級果率提高30％，成本下降二至三成，增收30％以上。20年多來，隨著閩臺農業交流合作不斷深入，從蔬菜、花卉、特種養殖到食品加工、竹木加工，從引進推廣臺灣的瓜菜、水果、水產等近百個良種到推廣無公害栽培、水果綜合改造、保護地栽培、工廠化育苗等20多項新技術、新模式，兩地的合作交流不僅給臺灣投資者以豐厚的經濟回報，也帶動了福建農業結構調整、產業升級和農民增收，閩臺農業合作已取得了互惠雙贏的喜人成果。