延安時期，具體指1935年10月19日中共中央隨紅軍長征到達陜北吳起鎮，到1948年3月23日在陜北吳堡縣東渡黃河迎接人民解放戰爭勝利的近13年時間。這一時期里，中國共產黨以馬克思主義民族觀為指導，結合中國具體國情，從政治、經濟、文化等多領域，積極開展民族團結教育工作，并形成了一套涵蓋教育組織、區域自治、經濟扶助、宗教信仰、文化教育等方面的民族團結教育工作的成熟理論方法，開創了民族團結教育工作新局面。

一、建立民族團結工作教育組織

建立民族工作組織機構。1936年初，成立了以張聞天為書記，漢族、蒙古族和回族同志組成的中央西北工作委員會（簡稱西工委），下設民族問題研究室，負責陜、甘、寧、青、綏五省的少數民族工作，特別是回族和蒙古族團結教育工作。西工委成立后，在廣泛調研的基礎上，形成《關于回回民族問題的提綱》和《關于抗戰中蒙古民族問題的提綱》。這兩個提綱是指導當時民族工作的綱領性文件，為中國共產黨制定民族區域等政策提供了科學依據，大為推進了民族工作的開展。之后，1937年7月成立了少數民族工作委員會，1941年5月成立了中共中央西北局，下設少數民族工作委員會。

健全民族工作組織體系。陜甘寧邊區政府設立了少數民族事務委員會，并在下屬的分區、縣、市等少數民族集中的地方設立民族事務科或民族事務科員。所有這些，都是為了處理少數民族問題而設置的，對于開展少數民族工作起了重要作用。形成層次明晰的民族組織體系。民族團結教育組織體系的建立，對于開展少數民族工作、加強民族團結教育工作起到了重要作用。

二、開展民族區域自治管理

延安時期，中國共產黨以馬克思主義民族理論為指導，第一次科學地提出了解決中國民族問題的理論——民族區域自治，并在陜北等地初步實施這一政策，鞏固和發展各族人民大團結。

形成民族區域自治管理政策。民族區域自治的最核心思想是民族平等思想。1939年公布的《陜甘寧邊區抗戰時期施政綱領》中就明確規定“實現蒙、回民族在政治上、經濟上與漢族的平等權利”。1941年5月1日公布的《陜甘寧邊區施政綱領》規定：“依照民族平等原則，實行蒙、回民族與漢族在政治經濟文化上的平等權利，建立蒙、回民族自治區”。這兩個文件明確了民族區域自治的思想和方式，落實了民族平等政策。

開展民族區域自治。1936年豫海縣成立回民自治縣，定邊縣的四、五區和城關鎮的兩個村成立回民自治鄉，曲子縣的三岔鎮成立回民自治區，新正縣的一、九區和鹽池縣的回六莊成立回民自治區。在這些地方，由回族人自己選舉區長、鄉長，管理區、鄉內的政治、經濟、文化事業。1942年4月，在黨中央和毛澤東的指導下，邊區政府劃定了定邊的四、五區和鎮關鏡的兩個自然村為回民自治區。同年9月，又劃定曲子縣納三岔鎮為回民自治區。之后，又在部分回民聚居的鄉村劃定若干自治區和自治鄉，并將選舉權、管理權完全交給自治區內的少數民族。

少數民族參政議政。1939年2月1日陜甘寧邊區第一屆參議會和1941年11月第二屆參議會都對少數民族參加選舉作了具體規定，提出了少數民族參政議政。在陜甘寧邊區第二屆參議會上有7位回族代表當選為邊區參議員，在第三屆參議會(1946年4月)上又有3位回族代表當選。