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森林資源多彩多姿。南北植物交匯區，既有溫帶、暖溫帶落葉闊葉樹種，又有亞熱帶常綠、落葉闊葉樹種。古樹參天，森林茂密，森林覆蓋率達89%。石燕寨周圍保存有300多畝短柄枹櫟原始森林，它是秦嶺地區面積最大、最古老、郁閉度最高的短柄枹櫟原始森林。蘭科植物隨處可見，林間的苔蘚、蕨類等低等植物十分豐富，形成獨具特色的峽谷生態系統。公園內有森林植物1696種；已經證實的有紅豆杉、大果青樹、香果樹、朵椒、蘭科植物等珍稀植物30余種，還能見到亞熱帶罕見的植物“絞殺”現象。真是一處天然氧吧，到此一游，有一日過三帶之體驗。