下午的故障情況較上午嚴重，故障間隔時間延長，15：00到17：00中斷長達2個小時，很多當天乘車的旅客無法購票上車。

時值春運，加上學生購票高峰，福州火車站售票大廳立即成了人的海洋，據在此等候購票的盧先生介紹，他13時到車站的時候，窗口前的隊伍排到廣場大門，后來有些等得太久的旅客就離開了。他是從莆田專門趕到福州買票的，他怕買不到回河北老家的票，還怕晚上趕不回莆田，他說：“住在福州，也得花一張火車票的錢。”

由于上午故障情況不太嚴重，福州火車站并沒有啟動應急預案，只在廣播里斷續地播報著提示。就這樣，售票窗口前排隊購票的人越來越多，隊伍挪動的速度時快時慢，人們開始抱怨。到了下午，系統徹底癱瘓了，中斷時間長達2個小時，馬上要開行的火車等在了站臺，而車票卻一張都賣不出去。16時左右，車站開始啟動預案，增派人手維持現場秩序，做好解釋工作，11、12、14號窗啟動作為應急窗口，窗口只出售當天開行火車車票，且票面全部為舊版無座車票(實際上有座，只是電腦無法生成，上車后協調座位)，馬上開行的火車，旅客可上車后補票。

截至下午5時55分，系統恢復正常，車站繼續售票。車站方面表示，故障將不會影響到接下來的售票。