某駐京辦負責人披露：“中央各部委除了預算資金外，還有一筆中央轉移支付款項。這些‘大錢’在握的部委，正是駐京辦重點公關對象，他們怎么花的錢，人大不知道，老百姓更不清楚，公共財政成了部門甚至少數人任意支配的‘小金庫’。”這名駐京辦負責人描述的可信度有多大，尚待求證，但顯然這些轉移支付款項，的確存在不透明的現象，再加上當前的審批制度不夠完善、監督機制不夠健全，難免就留下暗箱操作的空間。

當然，即便中央資金的審批制度不夠完善、監督機制不夠健全，也不是駐京辦存留的理由，而且一些駐京辦也存在諸多劣跡。2006年，時任中紀委書記吳官正在中央紀委第六次全會上就明確指出，要“防止和解決一些地方和企業駐京辦事機構存在的請客送禮等不正之風”。

應從兩方面入手：一是對保留下來的駐京辦，要強化監督，促使駐京辦進行職能轉變，強化服務功能；二是強化部委項目審批過程的透明度，擴大監督，保證權力運作公開透明。不過，如果不從體制根源找出癥結，即便撤銷了駐京辦，還有其他辦。換言之，類似駐京辦的機構會披著其他馬甲暗流洶涌，甚至冠冕堂皇地走上桌面。