與此同時，兩岸關系也在持續改善之中，海峽兩岸之間實現了三通，簽署了多項經濟、文化合作協議。總體而言，美國主流觀點認為，兩岸接近符合美國利益，使美國擺脫了進退兩難的境地。在陳水扁時代，臺獨勢力實際上綁架了美國，利用美國對臺灣的安全承諾，不斷地制造麻煩，美國不得不一次又一次出來滅火。一方面，美國要在政治、軍事和經濟等領域支持臺灣，維護臺灣的“民主制度”，增強臺灣“平衡”大陸的實力；另一方面，美國又要遏制臺獨活動。因此，美國對臺政策常常陷入兩難，在支持臺灣和反對臺獨之間徘徊。

《中美聯合聲明》指出，雙方強調臺灣問題在中美關系中的重要性。中方強調，臺灣問題涉及中國主權和領土完整，希望美方信守有關承諾，理解和支持中方在此問題上的立場。美方表示奉行一個中國政策，遵守中美三個聯合公報的原則。美方歡迎臺灣海峽兩岸關系和平發展，期待兩岸加強經濟、政治及其他領域的對話與互動，建立更加積極、穩定的關系。雙方重申，互相尊重主權和領土完整這一根本原則是指導中美關系的中美三個聯合公報的核心。雙方均不支持任何勢力破壞這一原則的任何行動。雙方一致認為，尊重彼此核心利益對確保中美關系穩定發展極端重要。

1997年的《中美聯合聲明》指出，中方強調，臺灣問題是中美關系中最重要最敏感的核心問題，恪守中美三個聯合公報的原則，妥善處理臺灣問題是中美關系健康、穩定發展的關鍵。美方重申，美國堅持一個中國政策，遵守中美三個聯合公報的原則。

對比分析上述兩個聲明的異同，可以看出以下幾個變化。第一，1997年僅僅是中方強調臺灣問題的重要性和敏感性，現在是雙方都承認臺灣問題的重要性。第二，在新的聯合聲明中，增加了“美方歡迎臺灣海峽兩岸關系和平發展，期待兩岸加強經濟、政治及其他領域的對話與互動，建立更加積極、穩定的關系”，這是美國對一年多來兩岸關系發展的正式表態。第三，美國尊重中國在臺灣問題上的立場和態度。中方認為臺灣問題涉及中國的主權和領土完整，是中國的核心利益。顯而易見，臺灣并不是美國的核心利益。然后，雙方一致認為，尊重彼此核心利益。這樣，可以解讀為，美國尊重中方在臺灣問題上的立場，可以包括對臺軍售等一系列議題。

除上述三大議題外，奧巴馬也在多個場合強調中美在人權問題上的不同立場，也傳達了希望同中國在能源、環保、科技、人文、國際問題等領域合作的愿望。

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