一旁的李先念也為他鼓勁：“要作個‘五年計劃’嘛。”陳云還是堅持自己的估計：“不，只作‘兩年計劃’，我這是滾動式的計劃。這樣更實際點。”他邊說邊用雙手做了個交替向前滾動的動作。

9月29日，薄一波來陳云辦公室商談工作。臨別時，薄一波也叮囑：“要多保重身體。”陳云笑道：“還是按我的計劃來，只作‘兩年計劃’。50年代我的身體就是‘木炭汽車’，我的身體是脆弱的平衡，能活到現在就不容易。”薄一波佩服地說：“柳宗元有句話，叫‘精壯暴死，久病延年’。這句話是很有道理的，你的身體就屬于‘久病延年’呀。”

黨內不同意三位老人只好“半退”

10月9日，陳云出席中央政治局擴大會議，聽取薄一波對十三大人事安排情況所作說明。人事安排，是個比較敏感的話題，尤其是最高領導層的安排，鄧小平、陳云、李先念三人早就商議過，他們在十三大時徹底退下來，不再擔任中央領導職務，為實現中央領導集體的新老交替作出表率。但中央政治局和黨內其他人一致反對，大家的意見，只同意他們“半退”，仍然擔任一定的職務。

10月19日，由陳云擔任第一書記的中紀委在北京召開了十三大前的最后一次全體會議。這次會議后，陳云將不再擔任中紀委第一書記。為讓大家理解自己的想法，陳云在會上作了說明，他還公布了1986年10月與鄧小平、李先念那次秘密談話的核心內容：“去年10月，小平同志、先念同志和我共同商定，十三大時一起退下來。這是黨的事業的需要。”

1987年10月25日，中國共產黨第十三次全國代表大會在北京人民大會堂開幕。陳云以大會主席團常務委員會成員身份走上主席臺……

大會的主題報告是《沿著有中國特色的社會主義道路前進》。為了這個報告的起草、修改和定稿，陳云和鄧小平、李先念等老一輩革命家花費了大量心血。后來，當代表中共中央作這個報告的中央負責人犯了政治錯誤時，有人對這個報告也提出一些不同意見。對此，陳云和鄧小平、李先念都主張：這個報告，不是哪一個人的，它代表了中央的集體智慧。

十三大結束后，陳云和鄧小平、李先念一起，退出了中央工作的第一線。由于還不能“全退”，陳云參加了中央顧問委員會的工作。

11月2日，已退出中央委員會的陳云，列席了中共十三屆一中全會。會議選舉產生了新的中央領導集體。全會決定鄧小平任中央軍事委員會主席；批準陳云為中央顧問委員會主任。中共中央最高領導層，順利實現了新老交替。