毛澤東在11月13日給斯大林的電報中轉(zhuǎn)述了彭的建議：“希望金日成同志和什特科夫同志能常駐前方，并由金日成、什特科夫、彭德懷組織三人小組，負(fù)責(zé)決定軍事政策，包括建軍、作戰(zhàn)、正面戰(zhàn)場和敵后戰(zhàn)場以及與作戰(zhàn)有關(guān)的許多現(xiàn)行政策，求得彼此意見一致，以利戰(zhàn)爭進(jìn)行。我們同意這個提議，現(xiàn)特電告，請求您的指示。如您認(rèn)為可行，即請由您處向什特科夫同志和金日成同志提出為妥”。毛澤東特別指出：“現(xiàn)在的重要問題是朝、蘇、中三國在那里的領(lǐng)導(dǎo)同志們能很好的團(tuán)結(jié)，對各項軍事政治政策能取得一致的意見，朝鮮人民軍和中國人民志愿軍在作戰(zhàn)上能有較好地配合，并能依照您的提議有相當(dāng)數(shù)量的朝鮮軍隊和中國志愿軍混合編制在一起（保存朝鮮軍隊的建制單位），倘能如此，勝利是有把握的。”17日，毛澤東致電彭、高說，斯大林已回電，完全贊成由中國同志來統(tǒng)一指揮，并將電告金日成和什特科夫。另外，蘇聯(lián)駐中國軍事總顧問扎哈羅夫也贊成統(tǒng)一指揮。毛澤東要彭觀察金日成的反應(yīng)。

鑒于莫斯科已表明態(tài)度，金日成便提出要去北京與毛澤東商談。在12月3日的會談中金說，斯大林有電報指示中朝軍隊?wèi)?yīng)統(tǒng)一指揮，因中國志愿軍有經(jīng)驗，應(yīng)由中國同志為正職，朝鮮同志為副職，朝鮮勞動黨政治局會議對此已同意。隨即，毛澤東告以中國方面推彭德懷為司令員兼政委，金日成提出金雄為副司令員，樸一禹為副政委，并確定以后聯(lián)合命令即由彭、金、樸三人署名，對志愿軍的單獨命令仍照以前署名不變。聯(lián)合司令部成立以后，凡屬作戰(zhàn)問題及前線一切活動均歸其指揮，后方動員、訓(xùn)練、軍政、警備等事則由朝鮮政府直接管轄，但聯(lián)司得向后方提出要求和建議。聯(lián)司下仍分為兩個機構(gòu)：志愿軍司令部和人民軍參謀部，合駐一處辦公。聯(lián)司的建立對外不公開，僅對內(nèi)行文用之。鐵道運輸、修理亦劃歸聯(lián)司指揮。會談后周恩來起草了《中朝兩方關(guān)于成立中朝聯(lián)合指揮部的協(xié)議》。金日成返回朝鮮后，7日同彭德懷再行商議具體事宜，所談甚為融洽。雙方商定數(shù)日內(nèi)組成聯(lián)合司令部，金保證今后不再直接干預(yù)軍事指揮，而且接受了中方的建議，取消此前對人民軍第3軍團(tuán)的部署，令其就近聽從志愿軍9兵團(tuán)宋時輪指揮。彭德懷對此表示滿意，并反復(fù)指出，“人民軍勇敢、頑強的精神和一套嚴(yán)格的蘇軍軍事管理制度，是值得學(xué)習(xí)的”；指令9兵團(tuán)干部，應(yīng)以學(xué)習(xí)的態(tài)度去了解第3軍團(tuán)的情況，可以“根據(jù)實際情況相機介紹中國建軍中的各項政治工作和地方工作經(jīng)驗”，但如與對方的原有制度有矛盾，“切不可生硬搬運”。

截至1951年4月15日，由于在中國受訓(xùn)的部隊回國，朝鮮人民軍共有7個軍團(tuán)。其中4個軍團(tuán)在聯(lián)合司令部領(lǐng)導(dǎo)下行動，3個軍團(tuán)直接隸屬于朝鮮人民軍總司令。除了地面部隊，空中作戰(zhàn)也需要聯(lián)合行動。1951年1月初，扎哈羅夫通告，蘇聯(lián)空軍兩個師將于近日入朝掩護(hù)輯安至江界、安東至安州兩線。此外，4月初中方空軍將有5個師、朝方空軍將有3個師參戰(zhàn)。因此，在蘇聯(lián)顧問的贊同下，中方提出需成立統(tǒng)一的空軍指揮部。后經(jīng)中朝協(xié)商，于3月參照聯(lián)司的組織原則成立了中朝空軍聯(lián)合集團(tuán)軍司令部。出于政治上的考慮及雙方語言不同的原因，蘇聯(lián)空軍未加入聯(lián)合司令部。